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@@ -45,11 +45,10 @@ d'analyse distantes.
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| Plateforme | Raspberry Pi 4 — Debian Linux |
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## Fonctionnalités
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- Pilotage du bras CNC en GRBL — déplacement automatique puits par puits
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- calibration des multi-puits avec synchro base de données
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- Calibration des multi-puits avec synchro base de données
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- Acquisition image haute définition via ArduCam (OpenCV + Picamera2)
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- Stockage des frames en base time série ReductStore
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- Sessions de scan paramétrables (grille complète ou sélection de puits)
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@@ -62,29 +61,28 @@ d'analyse distantes.
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- Interface administration Django (sqlite3 ou mariadb ou postgresql)
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- Suivi de progression des tâches longues par polling
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## Planaire simulation de mouvement aléatoire
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Supporte plusieurs planaires avec paramètres configurables via django ou csv.
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Supporte plusieurs planaires avec paramètres configurables via arguments CLI.
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Export CSV par planaire compatible EthoVision XT.
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Seuils EthoVision par défaut (configurables en arguments) :
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### Seuils EthoVision par défaut (configurables via django ou csv)
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- Immobile : déplacement < 0.2 mm/s
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- Mobile : 0.2 à 1.5 mm/s
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- Très mobile : > 1.5 mm/s
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- **Immobile** : déplacement < 0.2 mm/s
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- **Mobile** : 0.2 à 1.5 mm/s
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- **Très mobile** : > 1.5 mm/s
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- EthoVision CSV frames CSV summary
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- ========== ========== ===========
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- movedCenter-pointTotalmm total_distance_mm movedCenter_pointTotal_mm
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- VelocityCenter-pointMeanmm/s velocity_mm_s velocity_mean_mm_s
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- MovementMoving moving, duration_moving_s movement_moving_duration_s
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- MovementNot Moving duration_stopped_s movement_not_moving_duration_s
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- ImmobileFrequency / Duration mobility_state mobility_immobile_frequency/duration_s
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- MobileFrequency / Duration mobility_state mobility_mobile_frequency/duration_s
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- Highly mobileFrequency / Duration mobility_state mobility_highly_mobile_frequency/duration_s
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| EthoVision | CSV frames | CSV summary |
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|---|---|---|
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| movedCenter-pointTotalmm | total_distance_mm | movedCenter_pointTotal_mm |
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| VelocityCenter-pointMeanmm/s | velocity_mm_s | velocity_mean_mm_s |
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| MovementMoving | moving, duration_moving_s | movement_moving_duration_s |
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| MovementNot Moving | duration_stopped_s | movement_not_moving_duration_s |
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| ImmobileFrequency / Duration | mobility_state | mobility_immobile_frequency/duration_s |
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| MobileFrequency / Duration | mobility_state | mobility_mobile_frequency/duration_s |
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| Highly mobileFrequency / Duration | mobility_state | mobility_highly_mobile_frequency/duration_s |
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### Métriques calculées
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Métriques calculées :
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- Distance totale parcourue (mm) → movedCenter-pointTotalmm
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- Vitesse instantanée (mm/s) → VelocityCenter-pointMeanmm/s
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- Durée cumulée en mouvement (s) → MovementMoving
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@@ -92,11 +90,14 @@ Métriques calculées :
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- Fréquence et durée par état de mobilité → Mobility state (EthoVision)
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- Distance à la paroi (mm) → thigmotactisme
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Comportements simulés :
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- Thigmotactisme : attraction vers la paroi (--thigmotaxis)
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- Phototactisme : fuite de la lumière (--photo-mode, --photo-strength)
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- Chimiotactisme : attraction vers une source de nourriture (--chemo-strength)
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- Inter-individus : évitement de contact, agrégation, répulsion chimique
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### Comportements
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- **Thigmotactisme** : attraction vers la paroi (--thigmotaxis)
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- **Phototactisme** : fuite de la lumière (--photo-mode, --photo-strength)
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- **Chimiotactisme** : attraction vers une source de nourriture (--chemo-strength)
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- **Inter-individus** : évitement de contact, agrégation, répulsion chimique
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## Architecture
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