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@@ -119,6 +119,36 @@ Application 2: planarian Détection et suivi multi-individus de planaires dans u
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- **Chimiotactisme** : attraction vers une source de nourriture (--chemo-strength)
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- **Chimiotactisme** : attraction vers une source de nourriture (--chemo-strength)
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- **Inter-individus** : évitement de contact, agrégation, répulsion chimique
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- **Inter-individus** : évitement de contact, agrégation, répulsion chimique
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Application 4: Simulation de planaires
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- planarian_sim.py
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Espace circulaire de 16mm de diamètre, 500x500px
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Supporte plusieurs planaires avec paramètres configurables via arguments CLI.
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Export CSV par planaire compatible EthoVision XT.
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Comportements simulés :
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- Thigmotactisme : attraction vers la paroi (--thigmotaxis)
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- Phototactisme : fuite de la lumière (--photo-mode, --photo-strength)
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- Chimiotactisme : attraction vers une source de nourriture (--chemo-strength)
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- Inter-individus : évitement de contact, agrégation, répulsion chimique
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Usage:
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python3 planarian_sim.py [options]
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Exemples:
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python3 planarian_sim.py --count 5 --thigmotaxis 0.4
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python3 planaire_sim.py --count 5 --photo-mode fixed --photo-x 0.2 --photo-y 0.2 --photo-strength 0.6
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python3 planarian_sim.py --count 5 --chemo-x 0.7 --chemo-y 0.5 --chemo-strength 0.5
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python3 planarian_sim.py --count 5 --avoid-strength 0.6 --aggreg-strength 0.2
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- make_videos.sh
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- Générateur de vidéos paramétrables
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Usage:
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- ./make_video.sh (génère le fichier par défaut)
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- ./make_video.sh all (génère 24 vidéos pour 24 tubes à essais)
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## Architecture
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## Architecture
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@@ -12,13 +12,13 @@ Comportements simulés :
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- Inter-individus : évitement de contact, agrégation, répulsion chimique
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- Inter-individus : évitement de contact, agrégation, répulsion chimique
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Usage:
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Usage:
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python3 planaire_sim.py [options]
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python3 planarian_sim.py [options]
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Exemples:
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Exemples:
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python3 planaire_sim.py --count 5 --thigmotaxis 0.4
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python3 planarian_sim.py --count 5 --thigmotaxis 0.4
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python3 planaire_sim.py --count 5 --photo-mode fixed --photo-x 0.2 --photo-y 0.2 --photo-strength 0.6
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python3 planarian_sim.py --count 5 --photo-mode fixed --photo-x 0.2 --photo-y 0.2 --photo-strength 0.6
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python3 planaire_sim.py --count 5 --chemo-x 0.7 --chemo-y 0.5 --chemo-strength 0.5
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python3 planarian_sim.py --count 5 --chemo-x 0.7 --chemo-y 0.5 --chemo-strength 0.5
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python3 planaire_sim.py --count 5 --avoid-strength 0.6 --aggreg-strength 0.2
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python3 planarian_sim.py --count 5 --avoid-strength 0.6 --aggreg-strength 0.2
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"""
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"""
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import os
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import os
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os.environ.setdefault('DJANGO_SETTINGS_MODULE', 'home.settings')
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os.environ.setdefault('DJANGO_SETTINGS_MODULE', 'home.settings')
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