install

etc/1-install-sys.sh

@@ -11,7 +11,7 @@ echo "==== system essential"
 sudo apt -y install build-essential openssl git pkg-config redis supervisor sqlitebrowser samba-client cifs-utils gettext
 
 echo "==== python3 install"
-sudo apt -y install python3-dev python3-pip python3-venv default-libmysqlclient-dev libmariadb-dev libpq-dev python3-picamera2
+sudo apt -y install python3-dev python3-pip python3-venv libpq-dev default-libmysqlclient-dev libmariadb-dev python3-picamera2
 
 echo "==== supervisor http access login:pass => root:toor"
 sudo cp supervisor-inet_http.conf /etc/supervisor/conf.d/

etc/2-cargo-reductstore-install.sh

@@ -5,7 +5,7 @@ sudo apt install libprotobuf-dev protobuf-compiler
 
 curl --proto '=https' --tlsv1.2 -sSf https://sh.rustup.rs | sh
 
-source .cargo/env
+source $HOME/.cargo/env
 cargo --version
 rustc --version
 cargo install reductstore

etc/3-install-samba-client.sh

@@ -0,0 +1,60 @@
+#!/bin/bash
+
+# Script d'installation et de configuration d'un client Samba sur Raspberry Pi 4 (Debian Trixie)
+
+# Mise à jour des paquets
+echo "[1/5] Mise à jour des paquets..."
+sudo apt update && sudo apt upgrade -y
+
+# Installation des paquets nécessaires (client Samba et outils de montage)
+echo "[2/5] Installation des paquets nécessaires..."
+sudo apt install -y cifs-utils smbclient
+
+# Création du point de montage pour le partage distant
+echo "[3/5] Création du point de montage..."
+sudo mkdir -p /mnt/samba/public
+sudo mkdir -p /mnt/samba/secure
+
+# Demande des informations de connexion au partage Samba
+read -p "Adresse IP ou nom d'hôte du serveur Samba (ex: 192.168.1.10) : " samba_server
+read -p "Nom du partage public (ex: public) : " public_share
+read -p "Nom du partage sécurisé (ex: secure) : " secure_share
+read -p "Nom d'utilisateur Samba (laissez vide si partage public uniquement) : " samba_user
+if [ -n "$samba_user" ]; then
+    read -s -p "Mot de passe de l'utilisateur Samba : " samba_password
+    echo
+fi
+
+# Configuration des identifiants Samba (pour le partage sécurisé)
+if [ -n "$samba_user" ]; then
+    echo "[4/5] Configuration des identifiants pour le partage sécurisé..."
+    sudo bash -c "echo 'username=$samba_user' > /etc/samba/credentials"
+    sudo bash -c "echo 'password=$samba_password' >> /etc/samba/credentials"
+    sudo chmod 600 /etc/samba/credentials
+fi
+
+# Configuration du montage automatique dans /etc/fstab
+echo "[5/5] Configuration du montage automatique dans /etc/fstab..."
+# Sauvegarde du fichier fstab existant
+sudo cp /etc/fstab /etc/fstab.bak
+
+# Ajout des lignes pour monter les partages Samba
+if [ -n "$samba_user" ]; then
+    # Montage du partage sécurisé
+    sudo bash -c "echo '//$samba_server/$secure_share /mnt/samba/secure cifs credentials=/etc/samba/credentials,uid=1000,gid=1000,file_mode=0770,dir_mode=0770 0 0' >> /etc/fstab"
+fi
+
+# Montage du partage public (sans authentification)
+sudo bash -c "echo '//$samba_server/$public_share /mnt/samba/public cifs guest,uid=1000,gid=1000,file_mode=0777,dir_mode=0777 0 0' >> /etc/fstab"
+
+# Montage des partages
+echo "Montage des partages Samba..."
+sudo mount -a
+
+# Vérification du montage
+echo "Vérification des partages montés :"
+df -h | grep samba
+
+echo "Installation et configuration du client Samba terminées !"
+echo "Les partages sont montés dans /mnt/samba/public et /mnt/samba/secure."
+

etc/4-install_mariadb.sh

@@ -0,0 +1,76 @@
+#!/bin/bash
+
+# Script d'installation et de configuration de MariaDB
+# Utilisation : source mariadb_config.sh && ./install_mariadb.sh
+
+
+ENV_FILE="../test_tube_scanner/.env"
+source $ENV_FILE
+
+# Vérifie que le fichier de configuration est sourcé
+if [ -z "$DATABASE_ROOT_PASSWORD" ] || [ -z "$DATABASE_NAME" ] || [ -z "$DATABASE_USER" ] || [ -z "$DATABASE_PASSWORD" ]; then
+    echo "Erreur : Les variables de configuration ne sont pas définies."
+    echo "Sourcez le fichier de configuration avant d'exécuter ce script :"
+    echo "  source mariadb_config.sh && ./install_mariadb.sh"
+    exit 1
+fi
+
+# Mise à jour des paquets
+echo "[1/6] Mise à jour des paquets..."
+sudo apt update && sudo apt upgrade -y
+
+# Installation de MariaDB
+echo "[2/6] Installation de MariaDB..."
+sudo apt install -y mariadb-server
+
+
+# Sécurisation de MariaDB (désactive l'accès root à distance, supprime les bases de test, etc.)
+echo "[3/6] Sécurisation de MariaDB..."
+sudo mariadb_secure_installation <<EOF
+
+n
+y
+$DATABASE_ROOT_PASSWORD
+$DATABASE_ROOT_PASSWORD
+y
+y
+y
+y
+EOF
+
+# Création de la base de données, de l'utilisateur et attribution des droits
+echo "[4/6] Configuration de la base de données '$DATABASE_NAME' et de l'utilisateur '$DATABASE_USER'..."
+sudo mariadb -u root -p"$DATABASE_ROOT_PASSWORD" <<EOF
+CREATE DATABASE IF NOT EXISTS $DATABASE_NAME;
+CREATE USER IF NOT EXISTS '$DATABASE_USER'@'localhost' IDENTIFIED BY '$DATABASE_PASSWORD';
+GRANT ALL PRIVILEGES ON $DATABASE_NAME.* TO '$DATABASE_USER'@'localhost';
+FLUSH PRIVILEGES;
+EOF
+
+# Autoriser l'accès à distance (optionnel, si nécessaire)
+# Remplace '%' par une IP spécifique pour plus de sécurité
+echo "[5/6] Autorisation de l'accès à distance pour '$DATABASE_USER' (optionnel)..."
+sudo mariadb -u root -p"$DATABASE_ROOT_PASSWORD" <<EOF
+CREATE USER IF NOT EXISTS '$DATABASE_USER'@'%' IDENTIFIED BY '$DATABASE_PASSWORD';
+GRANT ALL PRIVILEGES ON $DATABASE_NAME.* TO '$DATABASE_USER'@'%';
+FLUSH PRIVILEGES;
+EOF
+
+# Redémarrage du service MariaDB
+echo "[6/6] Redémarrage du service MariaDB..."
+sudo systemctl restart mariadb
+sudo systemctl enable mariadb
+
+# Vérification du statut
+echo "Statut du service MariaDB :"
+sudo systemctl status mariadb --no-pager
+
+# Affichage des informations de connexion
+echo ""
+echo "=== Configuration terminée ==="
+echo "Base de données : $DATABASE_NAME"
+echo "Utilisateur : $DATABASE_USER"
+echo "Mot de passe : $DATABASE_PASSWORD"
+echo ""
+echo "Pour te connecter à MariaDB :"
+echo "  mariadb -u $DATABASE_USER -p$DATABASE_PASSWORD $DATABASE_NAME"

etc/5-install_adminer.sh

@@ -0,0 +1,81 @@
+#!/bin/bash
+
+# Script d'installation d'Adminer avec Nginx (sans Apache) + détection automatique de PHP
+
+# Mise à jour des paquets
+echo "[1/6] Mise à jour des paquets..."
+sudo apt update && sudo apt upgrade -y
+
+# Installation de Nginx et PHP-FPM (avec détection de la version de PHP)
+echo "[2/6] Installation de Nginx et PHP-FPM..."
+sudo apt install -y nginx
+
+# Détection de la version de PHP installée (ou installation si absente)
+PHP_VERSION=$(ls /etc/php/ | grep -E '^[0-9]+\.[0-9]+$' | sort -V | tail -n 1)
+if [ -z "$PHP_VERSION" ]; then
+    echo "Aucune version de PHP détectée. Installation de PHP 8.2 par défaut..."
+    sudo apt install -y php8.2 php8.2-fpm php8.2-mysql
+    PHP_VERSION="8.2"
+else
+    echo "Version de PHP détectée : $PHP_VERSION"
+    sudo apt install -y "php$PHP_VERSION" "php$PHP_VERSION-fpm" "php$PHP_VERSION-mysql"
+fi
+
+# Téléchargement de la dernière version stable d'Adminer
+echo "[3/6] Téléchargement de la dernière version d'Adminer..."
+ADMINER_VERSION=$(curl -s https://api.github.com/repos/vrana/adminer/releases/latest | grep '"tag_name":' | sed -E 's/.*"v([^"]+)".*/\1/')
+sudo mkdir -p /var/www/adminer
+sudo wget "https://github.com/vrana/adminer/releases/download/v$ADMINER_VERSION/adminer-$ADMINER_VERSION.php" -O /var/www/adminer/index.php
+
+# Configuration de Nginx pour Adminer
+echo "[4/6] Configuration de Nginx..."
+sudo bash -c "
+cat > /etc/nginx/sites-available/adminer <<'END'
+server {
+    listen 81;
+    server_name scanner.local;
+
+    root /var/www/adminer;
+    index index.php;
+
+    location / {
+        try_files \$uri \$uri/ =404;
+    }
+
+    location ~ \.php$ {
+        include snippets/fastcgi-php.conf;
+        fastcgi_pass unix:/var/run/php/php${PHP_VERSION}-fpm.sock;
+        fastcgi_param SCRIPT_FILENAME \$document_root\$fastcgi_script_name;
+        include fastcgi_params;
+    }
+}
+END"
+
+# Activation du site Nginx
+sudo ln -s /etc/nginx/sites-available/adminer /etc/nginx/sites-enabled/
+sudo nginx -t  # Teste la configuration Nginx
+
+# Redémarrage des services
+echo "[5/6] Redémarrage de Nginx et PHP-FPM..."
+sudo systemctl restart nginx "php${PHP_VERSION}-fpm"
+sudo systemctl enable nginx "php${PHP_VERSION}-fpm"
+
+# Ajout de l'entrée dans /etc/hosts (optionnel)
+echo "[6/6] Ajout de 'scanner.local' dans /etc/hosts..."
+echo "$(hostname -I | awk '{print $1}') scanner.local" | sudo tee -a /etc/hosts
+
+# Affichage des informations
+echo ""
+echo "=== Installation terminée ==="
+echo "Adminer est accessible à l'adresse : http://scanner.local:81"
+echo "ou via l'IP locale : http://$(hostname -I | awk '{print $1}'):81"
+echo "Version d'Adminer installée : $ADMINER_VERSION"
+echo "Version de PHP utilisée : $PHP_VERSION"
+echo "Ajouter 'scanner.local' au fichier hosts:"
+echo "    linux  : /etc/hosts"
+echo "    windows: C:\Windows\System32\drivers\etc\hosts"
+echo ""
+echo "Pour accéder à Adminer depuis cette machine:"
+echo "  http://scanner.local:81"
+echo "ou"
+echo "  http://$(hostname -I | awk '{print $1}')"

etc/install-linux-samba-server.sh

@@ -0,0 +1,84 @@
+#!/bin/bash
+
+# Script d'installation et de configuration d'un serveur Samba sur Debian Trixie
+
+# Mise à jour des paquets
+echo "[1/6] Mise à jour des paquets..."
+apt update && apt upgrade -y
+
+# Installation de Samba
+echo "[2/6] Installation de Samba..."
+apt install -y samba samba-common
+
+# Sauvegarde du fichier de configuration original
+echo "[3/6] Sauvegarde du fichier smb.conf original..."
+cp /etc/samba/smb.conf /etc/samba/smb.conf.bak
+
+# Configuration de Samba
+echo "[4/6] Configuration de Samba..."
+cat > /etc/samba/smb.conf << 'EOL'
+[global]
+   workgroup = WORKGROUP
+   server string = Serveur Samba %h
+   netbios name = DebianSamba
+   security = user
+   map to guest = bad user
+   dns proxy = no
+   socket options = TCP_NODELAY IPTOS_LOWDELAY SO_RCVBUF=65536 SO_SNDBUF=65536
+
+[public]
+   comment = Partage Public
+   path = /srv/samba/public
+   browsable = yes
+   guest ok = yes
+   read only = no
+   create mask = 0777
+   directory mask = 0777
+
+[secure]
+   comment = Partage Sécurisé
+   path = /srv/samba/secure
+   browsable = yes
+   guest ok = no
+   read only = no
+   create mask = 0770
+   directory mask = 0770
+   valid users = @smbgroup
+EOL
+
+# Création des répertoires de partage
+echo "[5/6] Création des répertoires de partage..."
+mkdir -p /srv/samba/public
+mkdir -p /srv/samba/secure
+chmod -R 0777 /srv/samba/public
+chmod -R 0770 /srv/samba/secure
+
+# Création d'un groupe pour le partage sécurisé
+echo "[5/6] Création du groupe smbgroup..."
+groupadd smbgroup
+
+# Ajout d'un utilisateur Samba (remplace 'utilisateur' par le nom d'utilisateur souhaité)
+echo "[5/6] Ajout d'un utilisateur Samba..."
+read -p "Entrez le nom de l'utilisateur Samba à créer : " username
+if id "$username" &>/dev/null; then
+    echo "L'utilisateur $username existe déjà."
+else
+    useradd -M -s /usr/sbin/nologin "$username"
+    usermod -aG smbgroup "$username"
+    (echo "motdepasse"; echo "motdepasse") | smbpasswd -a "$username"
+    echo "Utilisateur $username ajouté à Samba."
+fi
+
+# Redémarrage du service Samba
+echo "[6/6] Redémarrage du service Samba..."
+systemctl restart smbd
+systemctl enable smbd
+
+# Vérification du statut du service
+echo "Statut du service Samba :"
+systemctl status smbd --no-pager
+
+echo "Installation et configuration de Samba terminées !"
+echo "Le partage public est accessible sans authentification."
+echo "Le partage sécurisé est accessible avec l'utilisateur $username et le mot de passe défini."
+

etc/samba_mount.txt

@@ -1,17 +0,0 @@
-Montage samba:
-=============
-
-sudo nano /etc/samba/.smb_creds
-username=user_windows
-password=mot_de_passe
-domain=WORKGROUP
-
-sudo chmod 600 /etc/samba/.smb_creds
-sudo chown root:root /etc/samba/.smb_creds
-
-sudo mkdir -p /mnt/exports
-sudo chown django:django /mnt/exports
-
-sudo nano /etc/fstab
-//192.168.1.210/scanner  /mnt/exports_cam  cifs  credentials=/etc/samba/.smb_creds,uid=django,gid=django,file_mode=0664,dir_mode=0775,iocharset=utf8,vers=3.0,_netdev,nofail  0  0 
-

test_tube_scanner/.env.example

@@ -74,9 +74,10 @@ DATABASE_POSTGRES_PORT=5432
 ####
 # database
 #
+DATABASE_ROOT_PASSWORD=change_me
 DATABASE_NAME=test_tube
 DATABASE_USER=test_tube
-DATABASE_PASSWORD=ChangeMe
+DATABASE_PASSWORD=change_me
 
 ####
 ## reductstore

test_tube_scanner/scanner/admin.py

@@ -7,7 +7,7 @@ class WellAdmin(admin.ModelAdmin):
     list_display = ('name', 'author',)
 
 class ConfigurationAdmin(admin.ModelAdmin):
-    list_display = ('name', 'author', 'use_rpicam', 'video_width_capture', 'video_height_capture', 'video_frame_rate', 'px_per_mm', 'active',)
+    list_display = ('name', 'author', 'use_rpicam', 'video_width_capture', 'video_height_capture', 'video_frame_rate', 'active',)
 
 class MultiWellAdmin(admin.ModelAdmin):
     list_filter = ('author', )

test_tube_scanner/scanner/models.py

@@ -44,8 +44,7 @@ class Configuration(models.Model):
     # Grbl configuration
     grbl_xmax = models.FloatField(_("Grbl Xmax"), help_text=_("CNC Grbl Xmax en mm"), blank=False, default=350.0)
     grbl_ymax = models.FloatField(_("Grbl Ymax"), help_text=_("CNC Grbl Ymax en mm"), blank=False, default=250.0)
-    px_per_mm = models.FloatField(_("Pixel / mm"), help_text=_('Rapport pixel / déplacement en pixel/mm'), blank=False, default=2.5)
+
-    
     # camera configuration
     use_rpicam = models.BooleanField(_("Utiliser rpicam"), help_text=_("Par défaaut. Sinon USB webcam"), default=True)
     webcam_device_index = models.PositiveSmallIntegerField(_("Index de la webcam"), help_text=_("Index de la webcam (0, 1, ...) si présente"), default=2)
@@ -106,7 +105,7 @@ class MultiWell(models.Model):
     dy = models.FloatField(_("Pas Y"), help_text=_('Pas ou interval sur Y en mm'), blank=False, default=19.5)
     feed = models.PositiveIntegerField(_("Vitesse"), help_text=_('Vitesse déplacement en mm/mn '), blank=False, default=1000)
     
-    well_position = models.BooleanField(_("Positions"), help_text=_('Positions des puits générées ?'), default=False)
+    well_position = models.BooleanField(_("Positions"), help_text=_('Positions des puits générées ?. Non => efface WellPostion et recalcule les positions'), default=False)
     active = models.BooleanField(_("Active"), default=True)