tube aligner

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@@ -44,6 +44,8 @@ class Configuration(models.Model):
# Grbl configuration
grbl_xmax = models.FloatField(_("Grbl Xmax"), help_text=_("CNC Grbl Xmax en mm"), blank=False, default=350.0)
grbl_ymax = models.FloatField(_("Grbl Ymax"), help_text=_("CNC Grbl Ymax en mm"), blank=False, default=250.0)
px_per_mm = models.FloatField(_("Pixel / mm"), help_text=_('Rapport pixel / déplacement en pixel/mm'), blank=False, default=2.5)
# camera configuration
use_rpicam = models.BooleanField(_("Utiliser rpicam"), help_text=_("Par défaaut. Sinon USB webcam"), default=True)
webcam_device_index = models.PositiveSmallIntegerField(_("Index de la webcam"), help_text=_("Index de la webcam (0, 1, ...) si présente"), default=2)
@@ -57,7 +59,7 @@ class Configuration(models.Model):
calibration_default_multiwell = models.CharField(_("Multi-puits de calibration par défaut"), help_text=_("Position du multi-puits de calibration par défaut"), max_length=8, choices=MULTIWELL_POSITION, default='HG')
calibration_default_feed = models.PositiveIntegerField(_("Vitesse de calibration"), help_text=_("Vitesse de déplacement pour la calibration en mm/mn"), default=1000)
calibration_default_step = models.FloatField(_("Pas de calibration"), help_text=_("Pas de déplacement pour la calibration en mm"), default=1.0)
calibration_default_duration = models.FloatField(_("Duruée calibration"), help_text=_("Durée de pose entre chaque puits en s"), default=3.0)
active = models.BooleanField(_("Actif"), default=False)
class Meta:
@@ -80,15 +82,19 @@ class Well(models.Model):
def __str__(self):
return f'{self.name}'
class MultiWell(models.Model):
label = models.CharField(_("Label"), help_text=_("Label du multi-puit"), max_length=100, null=True, blank=True)
author = models.ForeignKey(User, on_delete=models.CASCADE, verbose_name="Auteur", null=True, blank=True)
position = models.CharField(_("Position"), help_text=_('Position du multi-puits sur la table'), unique=True, max_length=8, choices=MULTIWELL_POSITION, null=True, blank=False)
default = models.BooleanField(_("Par défaut"), help_text=_('Multi-puit par défaut'), default=False)
cols = models.PositiveSmallIntegerField(_("Colonnes"), help_text=_('Nombre de colonnes'), blank=False, default=6)
rows = models.PositiveSmallIntegerField(_("Lignes"), help_text=_('Nombre de lignes'), blank=False, default=4)
rows = models.PositiveSmallIntegerField(_("Lignes"), help_text=_('Nombre de lignes'), blank=False, default=4)
diameter = models.FloatField(_("Diamètre"), help_text=_('Diamètre des tubes en mm'), blank=False, default=16.0)
row_def = models.CharField(_("Définition"), help_text=_('Définition des lignes'), max_length=16, null=True, blank=False, default="A,B,C,D")
row_order = models.CharField(_("Ordre"), help_text=_('Ordre de lecture en serpentin'), max_length=16, null=True, blank=False, default="D,C,B,A")
row_order = models.CharField(_("Ordre ligne"), help_text=_('Ordre ligne de puit. Lecture en serpentin dans le sens des +- X'), max_length=16, null=True, blank=False, default="D,C,B,A")
order = models.PositiveSmallIntegerField(_("Ordre"), help_text=_('Ordre de lecture du multi-puit'), blank=False, default=0)
duration = models.PositiveIntegerField(_("Durée"), help_text=_('Durée du film en secondes'), blank=False, default=120)
@@ -98,10 +104,14 @@ class MultiWell(models.Model):
dx = models.FloatField(_("Pas X"), help_text=_('Pas ou interval sur X en mm'), blank=False, default=19.5)
dy = models.FloatField(_("Pas Y"), help_text=_('Pas ou interval sur Y en mm'), blank=False, default=19.5)
feed = models.PositiveIntegerField(_("Vitesse"), help_text=_('Vitesse déplacement en mm/mn '), blank=False, default=1000)
well_position = models.BooleanField(_("Positions"), help_text=_('Positions des puits générées ?'), default=False)
active = models.BooleanField(_("Active"), default=True)
def config(self):
return dict(
position=self.position,
cols=self.cols,
rows=self.rows,
row_def=self.row_def,
@@ -139,6 +149,56 @@ class MultiWell(models.Model):
def __str__(self):
return f'{self.position}: {self.label}'
class WellPostion(models.Model):
author = models.ForeignKey(User, on_delete=models.CASCADE, verbose_name="Auteur", null=True, blank=True)
well = models.ForeignKey(Well, verbose_name=_("Puit"), on_delete=models.SET_NULL, null=True, blank=True)
multiwell = models.ForeignKey(MultiWell, verbose_name=_("Multi-puits"), on_delete=models.SET_NULL, null=True, blank=True)
order = models.PositiveSmallIntegerField(_("Ordre"), help_text=_('Ordre de lecture du puit'), blank=False, default=0)
x = models.FloatField(_("X"), help_text=_('Axe X en mm'), blank=False, default=10.0)
y = models.FloatField(_("Y"), help_text=_('Axe Y en mm'), blank=False, default=10.0)
class Meta:
ordering = ['order']
unique_together = ["multiwell", "well"]
verbose_name = _("Position d'un puit")
verbose_name_plural = _("Position des puits")
def __str__(self):
return f'{self.multiwell.position}: {self.well.name}'
@receiver(post_save, sender=MultiWell)
def create_well_position(sender, instance, created, **kwargs):
if not instance.well_position:
row_order = instance.row_order.split(',')
n = 0
for row in range(instance.rows):
if row % 2 == 0:
cols = range(instance.cols)
else:
cols = range(instance.cols - 1, -1, -1)
for col in cols:
x = instance.xbase + col * instance.dx
y = instance.ybase + row * instance.dy
try:
name = f'{row_order[row]}{col+1}'
well = Well.objects.get(name__exact=name)
WellPostion.objects.update_or_create(
multiwell=instance,
well=well,
author=instance.author,
defaults={'order': n, 'x': round(x, 4), 'y': round(y, 4)}
)
n += 1
except:
pass
instance.well_position=True
instance.save()
class Observation(models.Model):
title = models.CharField(_("Titre de l'observation"), max_length=100, null=True, blank=False)
comment = models.TextField(_("Commentaires"), help_text=_("Descriptions de l'observations"), null=True, blank=True)